Wakaf Pendidikan akan memberi fokus untuk membantu mewujudkan infrastruktur asas dan kemudahan Pendidikan kepada pelajar-pelajar yang menuntut ilmu di Negeri Melaka. Bentuk pembangunan wakaf Pendidikan adalah dalam bentuk:  

1. Pembinaan Infrastruktur /Pembinaan Sekolah Agama/ Institusi Pendidikan Islam. 
2. Kemudahan peralatan Pendidikan seperti meja, kerusi peralatan dan sebagainya.
3. Pengambilan balik tanah bagi tujuan tapak Institusi Pendidikan Islam.
4. Penyediaan biasiswa pengajian kepada pelajar yang memerlukan dalam bidang-bidang pengajian yang kritikal.

Bagi tahun 2019-2021, Majlis Agama Islam Melaka mensasarkan kos sebanyak RM 10,500,00.00 (Ringgit Malaysia Sepuluh Juta Lima Ratus Ribu) yang mana melibatkan pembinaan 3 buah SRA JAIM di setiap daerah.